В Москве отмечено 35 видов рыб, преобладают плотва, лещ и окунь. На некоторых участках Москвы-реки в городе рыбы может быть очень много: минеральные и органические вещества в сточной воде благоприятны для трубочника, моллюсков и зоопланктона — основных кормов рыб.

Интересно, что городские рыбы слабо заражены гельминтами. Вероятно, паразитические черви в отличие от своих хозяев не переносят грязных вод. Однако, для рыб "сытная" жизнь в грязной воде не проходит даром: среди московских рыб много аномальных и уродливых, их число увеличивается по течению реки по мере увеличения ее загрязненности. Например, у плотвы доля рыб с отклонениями от нормы увеличивается от 10 — 20 % в Рублево и Строгино до 60 — 70 % при выходе реки из города.

Рыбы с аномальной морфологией из устья Яузы.
Вверху: плотва с редуцированными плавниками.
Внизу: плотва с "телескопическими" глазами.
(По: Соколов и др., 1994)

В теле московских рыб много нефтепродуктов и токсичных соединений металлов. Например, у окуня из устья Яузы содержание нефтепродуктов может превышать санитарные нормы в 250 раз. Так что есть городских рыб не стоит.